找到了!破解“组学码对于在的StorNext SIB(瑞士研究所的生物信息学)

生物信息学的SIB瑞士研究所是在生命科学,应用的计算方法,以基因组学,蛋白质组学和生物信息学等学科的下一个伟大的革命的最前沿。SIB的工作越来越重视应用基因组学,以提高生活质量。

“SIB最近一种算法工作为唐氏综合症等疾病产前诊断测试,”在生命-IT集团介绍教授扬Xenarios,董事。“用一个简单的血液从母亲11周画,我们可以测序胎儿的遗传物质在子宫内。这是创伤小,比传统羊膜穿刺术的风险要小得多。这也表明基因组学是如何成为我们每天的生活更相关“。

每周超过30TB会给数据管理带来独特的挑战

SIB运营着6个测序中心,支持大约300个研究团队,每周产生30TB的基因。

“在过去的几年中,测序变得更快,”罗伯托Fabbretti,资深科学家和IT经理的重要IT-解释。“这意味着我们比以往任何时候做更多的项目,我们的数据增长非常迅速。”

长期的研究需要数据管理

Xenarios说:“对于癌症和免疫治疗等领域的研究,我们收集了每位患者的大量测序数据。”“如果这个人每周或每月回来,研究人员需要在短时间内快速、准确地获得之前测试的所有数据。为了扩大我们的生物信息学努力,以支持成千上万的患者,我们需要寻找经济有效的方法来保存20年、30年或40年的基因组数据——有效地创建一个患者从出生到死亡的视图。”

高性能存储在千万亿次

如今,Vital-IT使用来自量子的StorNext扩展存储来支持其研究基础设施。研究人员通过四个单独的StorNext系统进行高速测序和分析——将近1PB的主存储器和4PB的经济磁带档案。StorNext支持使用Infiniband上的IP进行高性能处理,保持主存储上的活跃数据进行分析,并自动将文件移动到一个AEL磁带存档。超过600个用户在其中一个数据中心访问数据或通过CIFS接口远程访问数据。

自助式访问使基因组数据随时可供研究

“这些数据,我们的研究人员捕获和分析提供了重要的答案今天,但它也必须是有用的几个月或几年后,当新的分析应用程序可以提取相同的原始序列信息的潜力,” Fabbretti说。“的StorNext让我们能够为我们所有的项目提供高性价比的长期存档,无论一个项目是如何蓄谋已久最后一次。”

归档文件仍然出现在研究人员希望它们在文件系统中的位置,因此它们可以很容易地直接访问,而不需要IT支持。

“如果你给研究人员提供了一套正确的工具,他们就会挑战极限,”Xenarios说。“StorNext分层存储帮助我们快速获取数据,快速将其归档,并使其随时准备好,以便生物信息学家可以继续他们的工作。”

地球上一些最有价值的数据集的自动保护

“StorNext不仅帮助我们确保快速获取数据,它还使存档成为一个自动化的、经济有效的过程,帮助我们履行数据管家的职责,”Fabbretti说。“我们总是在磁带上复制两份文件,其中一份保存在档案馆中,另一份保存在档案库中,以提供额外的保护,防止任何类型的硬件故障或网站损坏。”

“我们正在处理一些地球上最有价值的数据集,”Fabbretti解释说。“StorNext为我们提供了多拍字节的存档能力、长期数据保护以及轻松回滚文件版本的能力——这是该策略中至关重要的一部分。”

可扩展性一直SIB准备好下一步怎么走

“六年多来,StorNext一直支持我们的增长。我们知道,在需要的时候可以轻松地增加磁盘和容量。事实上,我们已经超越了基因组学来存储和保护一般医学研究数据集。当需要扩展时,StorNext可以很容易地在存储工作流中包含云或对象存储等附加层,这对我们来说很重要。”亚搏电竞app下载